Metagenómica de la microbiota de juveniles del Litopenaeus vannamei inoculados con bacterias probióticas y patógenas

Resumen

El cultivo del camarón blanco Litopenaeus vannameies un recurso acuícola de gran importancia económica a nivel mundial. No obstante, es severamente afectado por varios tipos de enfermedades infecciosas, principalmente virales y bacterianas. Para asegurar la sostenibilidad de la industria del camarón, se debe mejorar la productividad en particular mediante el uso de mix de bacterias probióticas eficientes para la prevención de las enfermedades bacterianas. La metagenómica dirigida al ADN ribosómico bacteriano representa una potente herramienta para analizar la microbiota del camarón y evaluar mix de bacterias probióticas. En el presente estudio, dos mix (CA1 y CA2) de bacterias probióticas de Bacillusspp. fueron evaluados frente a bacterias patógenas (Vibriospp., Pseudomonas aeruginosa, Photobacterium damselaey Staphylococcusspp.), en infecciones experimentales con la determinación subsecuente por metagenómica de los cambios de composición microbiana de los intestinos de juveniles en paralelo a los respectivos incrementos de sobrevivencia. Los dos mix de bacterias probióticas CA1 y CA2 condujeron a cambios importantes en la composición de la microbiota intestinal, en particular a nivel de la riqueza de la microbiota. Además de incrementos generalmente significativos de las sobrevivencias en todas las condiciones. Este estudio de metagenómica de la microbiota de L. vannameiabre la vía a una mejor comprensión de las relaciones camarón-bacterias para la selección de mezcla de bacterias probióticas y el uso de prebióticos, así como para futuras investigaciones metagenómicas centradas en la microbiota de otros órganos (hepatopáncreas, hemolinfa , ovarios) o componentes de cultivo (biofilm, periphyton, bioflocs, suelos, agua).